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環境功能基因組Functional Gene Arrays

產品簡介

GeoChip 功能基因芯片由國際著名學者,勞倫斯獎(The Ernest Orlando Lawrence Award,2015)獲得者周集中(Joe Jizhong Zhou)教授及其團隊研發,是環境基因組學研究的一個重大突破。
GeoChip是一種基于全球基因組公共數據庫并針對微生物相關的各類功能基因設計特異性的寡核苷酸探針,從而揭示微生物群落功能基因的多樣性的高通量宏基因組檢測工具。最新的GeoChip 5.0版本涵蓋超過570,000種探針,靶向與基礎生物地球化學循環、能量代謝及熱點研究主題密切相關的2400多種功能基因家族中260,000余種編碼基因。該技術作為每年100項最具創新的科學技術發明,榮獲美國R&D雜志2009年頒發的R&D 100獎。

產品優勢

  • 重復性高

    平行樣品間結果重現性高

  • 檢測類群廣

    涵蓋多個功能類別,包括生物地球化學、能量循環、環境脅迫與抗性、有機污染物的生物降解、抗生素抗性及致病性相關的功能、次級代謝以及病毒相關的功能

  • 宿主基因組的干擾少

    GeoChip根據微生物相關的各類功能基因獨立設計特異性的探針,極大地降低了特殊樣品中動植物宿主基因組對微生物群落功能檢測的影響

  • 數據可讀性強

    與基于測序的宏基因組數據相比,GeoChip數據簡單易懂,可直接用于各類統計分析,有助于結果的解讀和比較

實驗流程

  • 樣品采集

  • 核酸(DNA/RNA)提取

  • 核酸檢測

  • 熒光標記

  • 芯片雜交

  • 芯片掃描與成像

分析流程

技術參數

  • 測試策略

    DNA或cDNA

    RNA

  • 數據量

    60K/180K

    60K/180K

  • 周期

    55個工作日

    65個工作日

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